La pielonefrite acuta è meno comune della cistite acuta e si sviluppa quando i microbi, attraverso gli ureteri, risalgono dalla vescica verso i reni.
Può essere anche causata da batteri che arrivano ai reni attraverso il sangue (batteriemia) o più raramente attraverso la circolazione linfatica.
Un ostacolo al flusso dell’urina o il reflusso dell’urina dalla vescica verso gli ureteri sono i due fattori di rischio più comuni per la pielonefrite.