I microrganismi, detti anche microbi o germi, sono esseri viventi di piccolissime dimensioni, in genere formati da una unica cellula.

Sono diffusi ovunque e alcuni tipi sono capaci di sopravvivere in ambienti ostili (eccessivo calore, mancanza di ossigeno, carenza di nutrienti) o di resistere ai farmaci inventati per combatterli (resistenza batterica).

Si distinguono vari tipi di microrganismi: batteri, virus, funghi, lieviti.

Vengono chiamati patogeni i microrganismi pericolosi per la salute e commensali quelli che svolgono soprattutto funzioni benefiche e di supporto all’organismo.